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蛋白与代谢组学

微量/单细胞蛋白组学

产品介绍


1.1 背景介绍


常规的蛋白质组学需要一定的蛋白量才能进行后续的组学服务,本产品使用微量的细胞样品(200个细胞即可),就可以进行蛋白质组学研究。细胞是常见的组学研究样本。本产品线的主要特点是需求样本量少,可满足客户低样本量检测需求。


1.2 技术优势


过芯片的纳升级微量液滴蛋白处理系统蛋白鉴定需求量更低

当细胞个数较少时细胞的鉴定蛋白的覆盖度比较稳定


1.3 技术路线




使用DIA的方法进行微量细胞数据采集,实验包括两大部分:一部分是混合样本分馏分,使用DDA的采集模式建立谱图库;二是样本单独上机,使用DIA的采集模式,完成关键数据的采集,最后使用数据分析软件

两部分数据进行整合分析得到定量结果,随后对数据进行生物信息的相关分析。


1.4分析内容


1)差异蛋白筛选根据p value和FC筛选具有显著差异的蛋白;

2)火山图、聚类热图;

3)感兴趣蛋白的分布或表达的可视化展示;

4)GO、KEGG功能分析和通路分析,富集和差异蛋白改变相关的通路和功能进一步研究;

5)  PPI分析等。


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