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蛋白与代谢组学

4D-DIA/labelfree

1.1背景介绍



4D蛋白质组是新一代蛋白质组学分析技术, 由布鲁克公司与蛋白质组学领域的领军人物Matthias MannRuedi AebersoldJürgen Cox Ben CollinsHannes Roest等科研团队合作推出的技术。4D-Proteomics™: 在传统保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity) 的基础之上增加了第四维的离子淌度(mobility)的分离。4D label free/DIA蛋白组鉴定能力提高50%以上,对比常规的 label free/DIA具有鉴定数更多、样本量需求更少、鉴定更精准的。


1.2技术优势



蛋白鉴定数目更多、需要样本量更少(200ng)、覆盖度较高、鉴定更精准


1.3技术路线




1.4 分析内容


1)数据质控;

2)差异蛋白筛选根据p value和FC筛选具有显著差异的蛋白;

3)火山图、聚类热图;

4)感兴趣蛋白的分布或表达的可视化展示;

5)GO、KEGG功能分析和通路分析,富集和差异蛋白改变相关的通路和功能进一步研究;

6)  PPI分析等。


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