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基因组学

BSA性状定位/Graded-seq

背景简介



        Bulked-segregant analysis简称BSA,也叫混合分组分析,是一种利用样本混池的建库方式对动植物的极端性状进行QTL定位的一种方法。这种方法快速便捷,在亲本群体中选择表型极端的个体构建表型极端的子代群体,并对极端性状的子代群体进行混池测序,从而迅速定位到与目标基因具有紧密连锁的分子标记区域,进一步挖掘重要的功能基因。

Graded-seq是升级版的BSA,可对多个混池DNA进行分析。



 


分析流程



  



技术路线

 

 



 



分析内容


 





样本要求和测序方案


取样类型:具有重要极端性状的亲本,子代群体包括暂时分离群体F1、F2和永久分离群体RIL、NIL和DH


混池规模:子代数量最少30+30个起,推荐数量50+50个起。必须符合极端性状的要求。

测序深度:亲本测序深度最低20x起,推荐深度30x起。平均每个子代1x起,推荐2x起。  



 



 

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