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微生物组学

宏转录组测序


背景


        宏转录组学是在转录水平,以特定样本中微生物群落的全部转录本为研究对象,分析微生物群落的基因表达与调控。宏转录组测序,避开了微生物的分离培养,为研究人员提供了从整体水平研究特定环境,特定时期微生物群落基因组转录情况以及转录调控规律的高效工具。



 


技术优势


样本处理个性化:由于微生物样本组成复杂,将根据不同样本特点,针对性进行样本处理和文库制备。

数据分析优化:精选数据拼接软件,最大程度获取微生物群落基因组转录信息。

注释全面:采用最新版数据库,更精确地注释和分析微生物群落基因表达信息。

跨组学分析:从宏基因组到宏转录组,多个角度解析微生物群落结构与功能。





 



技术路线


 




 

 


分析内容

 

 






样本类型


样本类型:培养的细菌(≥ 5×106),组织,环境样品,总RNA等

RNA总量:≥ 5 μg,浓度:≥50ng  

OD值:260/230≥1.5;260/280≥1.8

完整性(bioanalyzer2100):RIN值≥7,28S/18S≥0.7,或者峰型锐利,模拟电泳图无弥散,5S峰显示正常的样品


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