首页

首页

转录组学

lncRNA测序

背景

        lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,广泛存在于各种生物体内,在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,与动植物的生长发育,人类的疾病发生有着密切关系,也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。





 

技术优势


文库优化:采用核糖体去除和链特异性文库构建方案,保留了完整的lncRNA和mRNA序列,以及序列方向性。

序列完整:对样本中几乎全部的lncRNA和mRNA序列进行鉴定和分析。

物种多元:对包括人类、动植物在内的许多物种的lncRNA进行鉴定和分析。

分析严谨:系统收集lncRNA数据库用于鉴定已知lncRNA,并设置严格的筛选条件用于发现新lncRNA。

关联全面:开展lncRNA与mRNA的关联分析,深入分析lncRNA调控网络。





 



技术路线


 



 

 


分析内容


 






样本类型

细胞,组织,全血,总RNA等

建议总RNA起始量:10 μg,最低5 μg,人/大鼠/小鼠样品可低至1ug,

浓度≥200 ng/μL(人/大鼠/小鼠样品可低至≥50ng/ul)



近期用户文章

1. Cui J,et al.(2017)Comparative transcriptome analysis between resistant and susceptible tomato allows the identification of lncRNA16397 conferring resistance to Phytophthora infestans by co-expressing glutaredoxin. The Plant Journal. doi: 10.1111/tpj.13408

2. Wang W, Zhuang Q, Ji K, Wen B, Lin P, Zhao Y, Li W, Yan C. (2017) Identification of miRNA, lncRNA and mRNA-associated ceRNA networks and potential biomarker for MELAS with mitochondrial DNA A3243G mutation. Scientific Reports 7(1), 41639.

3. Sun J, Yan J, Yuan X, Yang R, Dan T, Wang X, Kong G, Gao S. (2016) A computationally constructed ceRNA interaction network based on a comparison of the SHEE and SHEEC cell lines. Cell Mol Biol Lett 21(1), 21.

4. Hajarnis SS, Patel V, Aboudehen K, Attanasio M, Cobo-Stark P, Pontoglio M, Igarashi P. (2015) Transcription Factor HNF-1B Regulates MicroRNA-200 Expression Through a Long Noncoding RNA. Journal of Biological Chemistry [Epub ahead of print],

5. Tian-Zuo Wang, Min Liu, Min-Gui Zhao, Rujin Chen, Wen-Hao Zhang. (2015) Identification and characterization of long non-coding RNAs involved in osmotic and salt stress in Medicago truncatula using genome-wide high-throughput sequencing. BMC Plant Biology. 15:131.


杭州联川生物技术股份有限公司. All Rights Reserved.
浙ICP备15020535号