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VariantBaits™——液相捕获定制化Panel

VariantBaits™——液相捕获定制化Panel

项目介绍


        基于自主知识产权的μParaflo®微流体芯片平台合成RNA捕获探针,联川推出VariantBaits™大规模靶向文库制备系统。这套捕获系统是采用液相杂交技术捕获靶标DNA,使用生物素标记探针诱饵,探针序列与靶向序列互补,从而富集与制备靶向序列文库。特别重要的是,VariantBaits™可以灵活高效地按照用户的需求合成定制化的捕获探针文库。

        




建库原理



 


样本类型


全血,组织,基因组DNA,FFPE,细胞培养物,游离DNA等  





技术优势

探针合成基于自主知识产权的μParaflo®微流体芯片平台
 使用RNA捕获探针技术,捕获效率更高
 探针可靠性已获数十项应用验证*
 可制最小48人份试剂盒 




 

性能表现

        基于这套高效的靶向捕获系统,用户只需使用较低的测序深度,即可获取令人满意的测序覆盖度(如图)。在测序深度100x(PE150)时,> 96%的靶向序列具有20x以上覆盖度,> 92%的靶向序列具有30x以上覆盖度。



定制流程

*部分文献

1. Gao X, Church, GM, et al. (2004) Accurate multiplex gene synthesis from programmable DNA chips. Nature 432, 1050-1054.

2. Baker SC, Bauer SR, et al. (2005) The External RNA Controls Consortium: a progress report. Nat Methods 2(10), 731-34.

3. Teer JK, Bonnycastle LL, et al. (2010) Systematic comparison of three genomic enrichment methods for massively parallel DNA sequencing. Genome Res 20(10), 1420-31.

4. Matzas M, Stähler PF, et al. (2010) High-fidelity gene synthesis by retrieval of sequence-verified DNA identified using high- throughput pyrosequencing. Nat Biotechnol 28(12), 1291-94.

5. Myllykangas S, Buenrostro JD, et al. (2011) Efficient targeted resequencing of human germline and cancer genomes by oligonucleotide-selective sequencing. Nat Biotechnol 29, 1024-27.

6. Eroshenko N, Kosuri S, et al. (2012) Gene Assembly from Chip-Synthesized Oligonucleotides. Current Protocols in Chemical Biology 1–17.

7. Diep D, Plongthongkum N, Gore A, Fung H, Shoemaker R, Zhang K. (2012) Library-free methylation sequencing with bisulfite padlock probesNature Methods 9(3), 270-2.

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